- Huperzia acerosa
- Huperzia appressa - Appalachian firmoss
- Huperzia arctica (Tolm.) Sipl. - Arctic firmoss
- Huperzia attenuata
- Huperzia australiana
- Huperzia balansae
- Huperzia billardieri
- Huperzia brachiata
- Huperzia bradeorum
- Huperzia brevifolia
- Huperzia campiana
- Huperzia capellae
- Huperzia capillaris
- Huperzia carinata
- Huperzia chamaeleon
- Huperzia compacta
- Huperzia crassa
- Huperzia cumingii
- Huperzia cuneifolia
- Huperzia curvifolia
- Huperzia dacrydioides
- Huperzia dentata
- Huperzia dichaeoides
- Huperzia dichotoma (Phlegmariurus dichotomus)
- Huperzia ericifolia
- Huperzia eversa
- Huperzia filiformis
- Huperzia foliacea
- Huperzia fordii
- Huperzia funiformis
- Huperzia heteroclita
- Huperzia hippuridea
- Huperzia hippuris
- Huperzia hoffmannii
- Huperzia holstii
- Huperzia homocarpa
- Huperzia horizontalis
- Huperzia hystrix
- Huperzia lancifolia
- Huperzia lindenii
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- Huperzia linifolia
- Huperzia lockyeri
- Huperzia lucidula - shining firmoss
- Huperzia mannii
- Huperzia megastachya
- Huperzia mesoamericana
- Huperzia mingcheensis (Phlegmariurus mingcheensis)
- Huperzia mollicoma
- Huperzia myrsinites
- Huperzia nummularifolia
- Huperzia nutans (Oʻahu, Kauaʻi)
- Huperzia ophioglossoides
- Huperzia pflanzii
- Huperzia phlegmaria
- Huperzia phlegmarioides
- Huperzia pithyodes
- Huperzia pittieri
- Huperzia polycarpos
- Huperzia polydactyla
- Huperzia porophila - rock firmoss
- Huperzia prolifera
- Huperzia reflexa
- Huperzia rosenstockiana
- Huperzia rufescens
- Huperzia sarmentosa
- Huperzia selago - Northern firmoss
- Huperzia serrata - source of Huperzine A
- Huperzia sieboldii
- Huperzia squarrosa
- Huperzia subulata
- Huperzia talamancana
- Huperzia tauri
- Huperzia taxifolia
- Huperzia tenuis
- Huperzia tetragona
- Huperzia tetrasticha
- Huperzia tubulosa
- Huperzia unguiculata
- Huperzia varia
- Huperzia verticillata
- Huperzia wilsonii
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